Coloca la rejilla del horno a unos 15 cm de la fuente de calor y precalienta el asador. Forra una bandeja para hornear con papel aluminio. Coloca los chiles poblanos con el lado cortado hacia abajo sobre la bandeja preparada.

Asa bajo el asador precalentado hasta que las pieles de los chiles poblanos estén negras y ampolladas, de 5 a 8 minutos. Coloca los chiles negros en un bol y cúbrelos bien con plástico. Deja que los chiles se vaporicen mientras se enfrían, aproximadamente 10 minutos.

Calienta una sartén grande a fuego medio-alto. Agrega la carne, el chile en polvo, el ajo, el comino, el orégano, la pimienta de cayena, el pimentón, el chile chipotle, la sal y la pimienta negra. Cocina y revuelve hasta que la carne ya no esté rosada, aproximadamente 4 minutos. Agrega la cebolla; cocina hasta que esté ligeramente blanda, aproximadamente 2 minutos. Agrega los tomates con chiles verdes; cocina hasta que las cebollas estén translúcidas, unos 5 minutos más. Deja enfriar la mezcla de carne.

Precalienta el horno a 175 grados C (350 grados F). Rocía un molde para hornear con spray para cocinar.

Pasa agua sobre los chiles poblanos para eliminar las pieles y deséchalas; escurre los chiles sobre toallas de papel. Coloca una capa de chiles en el fondo del molde preparado; coloca 1/3 de la mezcla de carne encima. Cubre con 1 taza de mezcla de queso mexicano rallado. Repite las capas dos veces más en el mismo orden.