Corta los bulbos de hinojo por la mitad a lo largo. Retira los corazones duros. Corta finamente el hinojo. Corta las cebollas por la mitad a lo largo y también córtalas finamente.

Calienta el aceite de oliva en una sartén grande a fuego medio. Agrega el hinojo y las cebollas; cocina y revuelve hasta que las cebollas estén translúcidas, aproximadamente 8 minutos. Agrega el vino y cocina hasta que casi se haya evaporado y el hinojo y las cebollas comiencen a dorarse, unos 8-10 minutos.

Lleva a ebullición una olla grande con agua ligeramente salada. Cocina la pasta linguini hasta que esté tierna pero firme al morder, aproximadamente 11 minutos. Reserva 1/4 de taza de agua de la pasta y escurre la pasta, manteniéndola caliente.

Incorpora los tomates a la mezcla de hinojo; cocina hasta que se ablanden, unos 3 minutos. Agrega el jugo de limón y los piñones.