Coupez les bulbes de fenouil en deux dans le sens de la longueur. Retirez les cœurs durs. Tranchez finement le fenouil. Coupez les oignons en deux dans le sens de la longueur et tranchez-les également finement.

Chauffez l'huile d'olive dans une grande poêle à feu moyen. Ajoutez le fenouil et les oignons; faites cuire et remuez jusqu'à ce que les oignons soient translucides, environ 8 minutes. Ajoutez le vin et faites cuire jusqu'à ce que le vin soit presque évaporé et que le fenouil et les oignons commencent à dorer, environ 8 à 10 minutes.

Portez à ébullition une grande casserole d'eau légèrement salée. Faites cuire les linguines jusqu'à ce qu'elles soient tendres mais encore fermes à la morsure, environ 11 minutes. Réservez 1/4 de tasse d'eau de cuisson des pâtes et égouttez les linguines, en les gardant au chaud.

Incorporez les tomates dans le mélange de fenouil; faites cuire jusqu'à ce qu'elles soient ramollies, environ 3 minutes. Ajoutez le jus de citron et les pignons de pin.