Panaskan oven hingga 400 derajat F (200 derajat C).

Didihkan panci besar berisi air yang diberi sedikit garam. Masak macaroni siku dalam air mendidih, aduk sesekali, sampai empuk tetapi masih kenyal saat digigit, sekitar 8 menit. Tiriskan dan sisihkan.

Lelehkan 1/4 cangkir mentega dalam panci besar di atas api sedang. Saat mentega mulai berbusa dan berbuih, aduk tepung; masak dengan api sedang hingga tepung mulai berubah menjadi kuning pucat, sekitar 3 hingga 4 menit.

Tambahkan thyme, cayenne, dan merica putih; masak dan aduk selama satu menit lagi, lalu kocok 1 cangkir susu hingga halus. Tuangkan susu yang tersisa dan aduk kembali. Panaskan saus hingga hampir mendidih.

Aduk garam, saus Worcestershire, dan pala. Didihkan perlahan, aduk sering, di atas api sedang-rendah hingga mengental, sekitar 8 menit.

Matikan api, lalu tambahkan 2 1/4 cangkir keju Cheddar; aduk hingga meleleh dan tercampur. Campurkan mustard Dijon.

Pindahkan macaroni ke dalam loyang casserole berukuran 8x8 inci, lalu tuangkan saus keju; aduk untuk mencampur pasta dengan saus secara menyeluruh.

Campurkan remah roti panko dan 1 sendok makan mentega cair dalam mangkuk kecil.

Taburkan campuran di atas macaroni dan keju. Taburkan sisa 3/4 cangkir keju Cheddar di atasnya.