Panaskan oven hingga 350 derajat F (175 derajat C). Olesi loyang pemanggang ukuran 9x13 inci.

Didihkan panci besar berisi air yang diberi sedikit garam. Masak cavatappi dalam air mendidih, aduk sesekali, sampai lembut namun masih kenyal saat digigit, sekitar 8 menit. Tiriskan.

Sementara pasta dimasak, lelehkan mentega dalam panci besar di atas api sedang-rendah. Kocok tepung ke dalam mentega yang telah meleleh hingga campuran memiliki konsistensi seperti pasta tebal, sekitar 30 detik. Perlahan-lahan masukkan 2 cangkir susu sambil terus dikocok hingga halus. Tambahkan sisa susu, naikkan panas ke sedang-tinggi, dan masak, terus-menerus diaduk hingga mengental dan hampir mendidih, selama 5 hingga 10 menit.

Tambahkan Gouda, Cheddar, Swiss, dan 1 cangkir Parmesan; aduk hingga keju meleleh dan saus menjadi halus. Campurkan cavatappi yang sudah matang hingga terlapisi. Tuangkan campuran tersebut ke dalam loyang yang sudah disiapkan.

Aduk ½ cangkir keju Parmesan dan remah roti bersama-sama dalam mangkuk kecil; taburkan di atas campuran cavatappi, lalu tuangkan minyak truffle di atasnya.