Kumpulkan semua bahan. Panaskan oven hingga 425 derajat F (220 derajat C) dengan rak di posisi tengah.

Campurkan bawang, minyak, dan tangkai thyme dalam panci berbawah tebal atau Dutch oven besar.

Panggang, tutup, di dalam oven yang sudah dipanaskan, aduk sekali di tengah proses, sampai bawang layu dan berwarna cokelat muda, sekitar 40 menit. Buka tutupnya dan lanjutkan memasak, aduk sesekali, sampai bawang berwarna cokelat keemasan dan karamel, sekitar 30 menit lagi.

Angkat dari oven dan adukkan sherry. Masak dengan api sedang, aduk terus, keruk sisa-sisa cokelat dari dasar dan sisi panci, sampai cairannya hampir menguap, sekitar 3 menit.

Aduk kaldu, Worcestershire, merica, garam, dan daun salam; didihkan dengan api besar. Kecilkan api menjadi sedang-rendah, dan didihkan perlahan, jangan diutak-atik, biarkan rasa menyatu bersama, sekitar 15 menit. Angkat dari api dan adukkan cuka sari apel. Buang tangkai thyme dan daun salam.

Naikkan suhu oven ke grill. Tuangkan sup secara merata ke dalam 6 mangkuk tahan grill atau cawan, dan letakkan mangkuk di atas loyang besar dengan pinggiran. Tambahkan 2 irisan roti dan sekitar 1/3 cangkir Gruyère di atas setiap mangkuk.