Panaskan oven hingga 325°F. Campur remah-remah biskuit jahe, pecan, dan mentega yang telah dilelehkan. Tekan dengan kuat di dasar dan 1 inci ke sisi loyang springform berukuran 9 inci.

Kocok cream cheese, 3/4 cangkir gula, dan vanila dengan mixer listrik hingga tercampur rata. Tambahkan telur satu per satu, aduk pada kecepatan rendah hingga tercampur. Ambil 1-1/2 cangkir adonan dan letakkan dalam mangkuk kecil.

Aduk gula 1/4 cangkir yang tersisa, labu, kayu manis, pala, dan cengkeh ke dalam sisa adonan di mangkuk. Sendokkan setengah dari adonan labu ke dalam kerak, lalu tambahkan sendok-sendok dari separuh adonan polos yang disisihkan. Ulangi lapisannya. Gunakan pisau untuk memotong adonan agar menciptakan efek marmer.

Panggang selama 55 menit atau hingga bagian tengah hampir mengeras. Dinginkan sepenuhnya.