Panaskan oven hingga 325°F (165°C). Semprotkan 2 loyang muffin mini berukuran 12 cangkir dengan semprotan masak anti lengket, pastikan setiap cangkir terlapisi dengan baik. Letakkan loyang di atas nampan.

Aduk bersama remahan biskuit graham, 1 sendok makan gula, mentega, dan 1/8 sendok teh ekstrak vanila dalam mangkuk hingga campuran remahan menyerupai pasir basah. Sendokkan satu sendok teh sedikit lebih banyak dari campuran remahan ke bagian bawah setiap cangkir dan buat lapisan yang rata.

Letakkan satu loyang muffin di atas yang lain dan tekan ringan untuk memadatkan remahan. Ulangi dengan loyang lainnya.

Campurkan keju krim yang sudah dilembutkan, 1/2 cangkir gula, dan 1/2 sendok teh ekstrak vanila dalam mangkuk. Kocok hingga ringan dan mengembang menggunakan mixer elektrik. Tambahkan tepung dan satu telur, kocok hingga tercampur, kemudian tambahkan telur kedua, aduk hingga halus.

Masukkan adonan ke dalam cetakan muffin menggunakan piping bag, isi hingga penuh. Gunakan tusuk sate untuk menghilangkan gelembung udara, dan ketuk loyang di meja untuk menetapkan adonan.

Panggang dalam oven selama 20–25 menit, atau hingga adonan naik sedikit dan retakan kecil muncul di permukaan. Cheesecake di bagian tengah mungkin akan memanggang lebih lambat daripada yang di pinggir.

Biarkan cheesecake dingin hingga suhu ruangan selama sekitar 20 menit, lalu keluarkan dari cetakan. Dinginkan dalam lemari es setidaknya selama 30 menit sebelum dihias.