Panaskan oven hingga 400°F (200°C). Campurkan labu kuning, 2 sendok teh minyak, 1/2 sendok teh garam, dan 1/4 sendok teh merica. Tata dalam satu lapisan di atas loyang berbingkai.

Panggang dalam oven yang sudah dipanaskan sampai lunak dan agak kecokelatan, selama 15 hingga 20 menit. Sisihkan.

Sementara itu, panaskan sisa 2 sendok teh minyak dalam wajan besar di atas api sedang-tinggi. Tambahkan bawang bombay dan 1/4 sendok teh garam, masak sambil diaduk sesekali sampai layu dan transparan, selama 3 hingga 4 menit. Masukkan bayam, masak sambil diaduk sesekali sampai layu, selama 1 hingga 2 menit. Angkat dari api, sisihkan.

Campurkan keju provolone parut dan mozzarella dalam mangkuk. Aduk bersama ricotta, peterseli, telur, 1 1/2 cangkir campuran keju parut, serta sisa 3/4 sendok teh garam dan 1/2 sendok teh merica dalam mangkuk besar.

Lapisi loyang panggang ukuran 13x9 inci dengan semprotan masak. Oleskan 1 cangkir marinara di dasar loyang. Tata 4 mie berdampingan di atas saus; oleskan separuh adonan ricotta di atas mie. Sebarkan labu panggang secara merata di atas adonan ricotta; tutup dengan 1 1/2 cangkir marinara. Tambahkan 4 mie lagi dan sisa adonan ricotta. Sebarkan campuran bayam secara merata di atas adonan ricotta; tutup dengan 1 1/2 cangkir marinara. Tambahkan sisa 4 mie dan 1 cangkir marinara. Taburi dengan Parmesan dan sisa campuran keju parut. Tutup dengan aluminium foil.